Esse famoso hábito do oriental (mas também de outras regiões, como na Finlândia) de não entrar nem que a vaca tussa com sapatos para dentro de casa deve ter a grande vantagem de deixar muitos germes perigosos na entrada (a genkan, o "hall de entrada" onde se retiram os sapatos para calçar chinelinhos).
Nunca vi nenhum estudo a respeito, mas a amostragem de bactérias à que os bebês que engatinham se submetem deve ser bem menor.
Acontece que o chão da casa é apenas parte - ainda que importante - da casa. Tem muito mais "bichinhos" escondidos nela, originados de outra fonte. O transporte de germes do banheiro, da cozinha, os celulares, os controles-remoto, as roupas de cama, as esponjas de lavar louça, o animal doméstico, etc. É bactéria por todo lugar!
Ainda que os orientais cuidem de tudo isso (são, por exemplo, muito mais econômicos nas "inutilidades" espalhadas pela casa e mais atentos aos detalhes), também eles têm sua cota de germe a gerar algum perigo, principalmente para infecções do trato digestivo.
Mas talvez a "germefobia" seja muito mais perigosa, até certa medida.